Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Prkab1Q9R078 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prkab1Q9R078 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prkab1Q9R078 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prkab1Q9R078 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prkab1Q9R078 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prkab1Q9R078 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prkab1Q9R078 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prkab1Q9R078 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prkab1Q9R078 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prkab1Q9R078 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prkab1Q9R078 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Prkab1Q9R078 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prkab1Q9R078 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prkab1Q9R078 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prkab1Q9R078 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prkab1Q9R078 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Prkab1Q9R078 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prkab1Q9R078 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prkab1Q9R078 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prkab1Q9R078 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prkab1Q9R078 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prkab1Q9R078 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Prkab1Q9R078 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prkab1Q9R078 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prkab1Q9R078 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prkab1Q9R078 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prkab1Q9R078 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prkab1Q9R078 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Prkab1Q9R078 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prkab1Q9R078 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prkab1Q9R078 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Prkab1Q9R078 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prkab1Q9R078 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Prkab1Q9R078 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prkab1Q9R078 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prkab1Q9R078 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prkab1Q9R078 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prkab1Q9R078 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prkab1Q9R078 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prkab1Q9R078 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prkab1Q9R078 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Prkab1Q9R078 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prkab1Q9R078 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prkab1Q9R078 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prkab1Q9R078 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prkab1Q9R078 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prkab1Q9R078 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prkab1Q9R078 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prkab1Q9R078 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prkab1Q9R078 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prkab1Q9R078 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Prkab1Q9R078 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prkab1Q9R078 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prkab1Q9R078 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prkab1Q9R078 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prkab1Q9R078 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prkab1Q9R078 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prkab1Q9R078 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prkab1Q9R078 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prkab1Q9R078 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prkab1Q9R078 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prkab1Q9R078 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms