Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BcamQ9R069 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BcamQ9R069 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BcamQ9R069 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BcamQ9R069 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BcamQ9R069 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BcamQ9R069 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BcamQ9R069 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BcamQ9R069 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BcamQ9R069 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BcamQ9R069 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BcamQ9R069 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BcamQ9R069 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BcamQ9R069 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BcamQ9R069 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BcamQ9R069 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BcamQ9R069 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BcamQ9R069 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BcamQ9R069 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BcamQ9R069 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BcamQ9R069 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BcamQ9R069 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BcamQ9R069 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BcamQ9R069 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BcamQ9R069 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BcamQ9R069 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BcamQ9R069 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BcamQ9R069 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BcamQ9R069 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BcamQ9R069 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BcamQ9R069 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BcamQ9R069 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BcamQ9R069 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BcamQ9R069 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BcamQ9R069 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BcamQ9R069 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BcamQ9R069 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BcamQ9R069 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BcamQ9R069 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BcamQ9R069 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BcamQ9R069 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BcamQ9R069 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BcamQ9R069 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BcamQ9R069 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BcamQ9R069 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BcamQ9R069 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BcamQ9R069 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BcamQ9R069 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BcamQ9R069 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BcamQ9R069 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BcamQ9R069 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BcamQ9R069 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BcamQ9R069 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BcamQ9R069 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BcamQ9R069 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BcamQ9R069 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BcamQ9R069 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BcamQ9R069 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BcamQ9R069 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BcamQ9R069 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BcamQ9R069 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BcamQ9R069 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BcamQ9R069 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BcamQ9R069 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BcamQ9R069 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BcamQ9R069 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BcamQ9R069 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BcamQ9R069 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BcamQ9R069 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
BcamQ9R069 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BcamQ9R069 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms