Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Fhl3Q9R059 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fhl3Q9R059 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fhl3Q9R059 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fhl3Q9R059 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Fhl3Q9R059 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fhl3Q9R059 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fhl3Q9R059 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fhl3Q9R059 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fhl3Q9R059 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fhl3Q9R059 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fhl3Q9R059 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fhl3Q9R059 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fhl3Q9R059 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fhl3Q9R059 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fhl3Q9R059 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fhl3Q9R059 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fhl3Q9R059 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fhl3Q9R059 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fhl3Q9R059 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fhl3Q9R059 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fhl3Q9R059 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fhl3Q9R059 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fhl3Q9R059 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fhl3Q9R059 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fhl3Q9R059 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fhl3Q9R059 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fhl3Q9R059 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fhl3Q9R059 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fhl3Q9R059 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fhl3Q9R059 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fhl3Q9R059 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Fhl3Q9R059 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fhl3Q9R059 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fhl3Q9R059 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fhl3Q9R059 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms