Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CtsjQ9R014 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CtsjQ9R014 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CtsjQ9R014 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CtsjQ9R014 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CtsjQ9R014 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CtsjQ9R014 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CtsjQ9R014 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CtsjQ9R014 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CtsjQ9R014 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CtsjQ9R014 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CtsjQ9R014 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CtsjQ9R014 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CtsjQ9R014 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CtsjQ9R014 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CtsjQ9R014 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CtsjQ9R014 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CtsjQ9R014 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CtsjQ9R014 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CtsjQ9R014 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CtsjQ9R014 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CtsjQ9R014 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CtsjQ9R014 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CtsjQ9R014 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CtsjQ9R014 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CtsjQ9R014 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CtsjQ9R014 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms