Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CtsfQ9R013 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CtsfQ9R013 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CtsfQ9R013 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CtsfQ9R013 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CtsfQ9R013 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CtsfQ9R013 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CtsfQ9R013 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CtsfQ9R013 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CtsfQ9R013 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CtsfQ9R013 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CtsfQ9R013 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CtsfQ9R013 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CtsfQ9R013 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CtsfQ9R013 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CtsfQ9R013 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CtsfQ9R013 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CtsfQ9R013 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CtsfQ9R013 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CtsfQ9R013 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CtsfQ9R013 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CtsfQ9R013 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CtsfQ9R013 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CtsfQ9R013 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CtsfQ9R013 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CtsfQ9R013 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CtsfQ9R013 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CtsfQ9R013 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CtsfQ9R013 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CtsfQ9R013 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CtsfQ9R013 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CtsfQ9R013 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CtsfQ9R013 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CtsfQ9R013 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CtsfQ9R013 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CtsfQ9R013 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CtsfQ9R013 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CtsfQ9R013 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CtsfQ9R013 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CtsfQ9R013 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CtsfQ9R013 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CtsfQ9R013 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CtsfQ9R013 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CtsfQ9R013 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CtsfQ9R013 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CtsfQ9R013 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CtsfQ9R013 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CtsfQ9R013 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CtsfQ9R013 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CtsfQ9R013 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CtsfQ9R013 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CtsfQ9R013 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CtsfQ9R013 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CtsfQ9R013 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CtsfQ9R013 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CtsfQ9R013 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CtsfQ9R013 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CtsfQ9R013 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CtsfQ9R013 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CtsfQ9R013 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CtsfQ9R013 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CtsfQ9R013 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CtsfQ9R013 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms