Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf4Q9QZS2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf4Q9QZS2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf4Q9QZS2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf4Q9QZS2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rnf4Q9QZS2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf4Q9QZS2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf4Q9QZS2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf4Q9QZS2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf4Q9QZS2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rnf4Q9QZS2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rnf4Q9QZS2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf4Q9QZS2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf4Q9QZS2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf4Q9QZS2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf4Q9QZS2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf4Q9QZS2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf4Q9QZS2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf4Q9QZS2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf4Q9QZS2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf4Q9QZS2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf4Q9QZS2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf4Q9QZS2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf4Q9QZS2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf4Q9QZS2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf4Q9QZS2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf4Q9QZS2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms