Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Npas3Q9QZQ0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Npas3Q9QZQ0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Npas3Q9QZQ0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Npas3Q9QZQ0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Npas3Q9QZQ0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Npas3Q9QZQ0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Npas3Q9QZQ0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Npas3Q9QZQ0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Npas3Q9QZQ0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Npas3Q9QZQ0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Npas3Q9QZQ0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Npas3Q9QZQ0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Npas3Q9QZQ0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Npas3Q9QZQ0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Npas3Q9QZQ0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Npas3Q9QZQ0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Npas3Q9QZQ0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Npas3Q9QZQ0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Npas3Q9QZQ0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Npas3Q9QZQ0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Npas3Q9QZQ0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Npas3Q9QZQ0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Npas3Q9QZQ0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Npas3Q9QZQ0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Npas3Q9QZQ0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Npas3Q9QZQ0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Npas3Q9QZQ0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Npas3Q9QZQ0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Npas3Q9QZQ0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Npas3Q9QZQ0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Npas3Q9QZQ0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Npas3Q9QZQ0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Npas3Q9QZQ0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Npas3Q9QZQ0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Npas3Q9QZQ0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Npas3Q9QZQ0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Npas3Q9QZQ0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Npas3Q9QZQ0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Npas3Q9QZQ0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Npas3Q9QZQ0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Npas3Q9QZQ0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Npas3Q9QZQ0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Npas3Q9QZQ0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms