Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfrsf10bQ9QZM4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfrsf10bQ9QZM4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfrsf10bQ9QZM4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfrsf10bQ9QZM4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfrsf10bQ9QZM4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms