Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Phtf1Q9QZ09 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phtf1Q9QZ09 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phtf1Q9QZ09 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phtf1Q9QZ09 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phtf1Q9QZ09 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phtf1Q9QZ09 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Phtf1Q9QZ09 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phtf1Q9QZ09 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phtf1Q9QZ09 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phtf1Q9QZ09 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phtf1Q9QZ09 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phtf1Q9QZ09 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phtf1Q9QZ09 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phtf1Q9QZ09 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Phtf1Q9QZ09 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phtf1Q9QZ09 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phtf1Q9QZ09 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phtf1Q9QZ09 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phtf1Q9QZ09 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phtf1Q9QZ09 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phtf1Q9QZ09 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phtf1Q9QZ09 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phtf1Q9QZ09 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phtf1Q9QZ09 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phtf1Q9QZ09 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phtf1Q9QZ09 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phtf1Q9QZ09 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phtf1Q9QZ09 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phtf1Q9QZ09 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Phtf1Q9QZ09 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Phtf1Q9QZ09 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Phtf1Q9QZ09 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phtf1Q9QZ09 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phtf1Q9QZ09 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phtf1Q9QZ09 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phtf1Q9QZ09 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phtf1Q9QZ09 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phtf1Q9QZ09 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phtf1Q9QZ09 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phtf1Q9QZ09 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phtf1Q9QZ09 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Phtf1Q9QZ09 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Phtf1Q9QZ09 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phtf1Q9QZ09 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phtf1Q9QZ09 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phtf1Q9QZ09 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Phtf1Q9QZ09 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Phtf1Q9QZ09 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Phtf1Q9QZ09 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phtf1Q9QZ09 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phtf1Q9QZ09 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phtf1Q9QZ09 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phtf1Q9QZ09 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Phtf1Q9QZ09 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Phtf1Q9QZ09 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Phtf1Q9QZ09 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Phtf1Q9QZ09 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms