Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Bcl11aQ9QYE3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Bcl11aQ9QYE3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Bcl11aQ9QYE3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Bcl11aQ9QYE3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Bcl11aQ9QYE3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Bcl11aQ9QYE3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Bcl11aQ9QYE3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Bcl11aQ9QYE3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Bcl11aQ9QYE3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Bcl11aQ9QYE3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Bcl11aQ9QYE3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Bcl11aQ9QYE3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Bcl11aQ9QYE3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Bcl11aQ9QYE3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Bcl11aQ9QYE3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Bcl11aQ9QYE3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Bcl11aQ9QYE3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Bcl11aQ9QYE3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Bcl11aQ9QYE3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Bcl11aQ9QYE3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Bcl11aQ9QYE3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Bcl11aQ9QYE3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Bcl11aQ9QYE3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Bcl11aQ9QYE3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Bcl11aQ9QYE3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Bcl11aQ9QYE3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Bcl11aQ9QYE3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Bcl11aQ9QYE3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Bcl11aQ9QYE3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Bcl11aQ9QYE3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Bcl11aQ9QYE3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Bcl11aQ9QYE3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Bcl11aQ9QYE3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Bcl11aQ9QYE3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Bcl11aQ9QYE3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Bcl11aQ9QYE3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Bcl11aQ9QYE3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Bcl11aQ9QYE3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Bcl11aQ9QYE3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Bcl11aQ9QYE3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Bcl11aQ9QYE3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Bcl11aQ9QYE3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Bcl11aQ9QYE3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Bcl11aQ9QYE3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Bcl11aQ9QYE3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Bcl11aQ9QYE3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Bcl11aQ9QYE3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Bcl11aQ9QYE3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Bcl11aQ9QYE3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Bcl11aQ9QYE3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Bcl11aQ9QYE3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Bcl11aQ9QYE3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Bcl11aQ9QYE3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Bcl11aQ9QYE3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Bcl11aQ9QYE3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Bcl11aQ9QYE3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Bcl11aQ9QYE3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Bcl11aQ9QYE3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Bcl11aQ9QYE3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Bcl11aQ9QYE3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Bcl11aQ9QYE3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Bcl11aQ9QYE3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Bcl11aQ9QYE3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Bcl11aQ9QYE3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Bcl11aQ9QYE3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Bcl11aQ9QYE3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Bcl11aQ9QYE3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Bcl11aQ9QYE3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Bcl11aQ9QYE3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Bcl11aQ9QYE3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Bcl11aQ9QYE3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Bcl11aQ9QYE3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Bcl11aQ9QYE3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Bcl11aQ9QYE3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Bcl11aQ9QYE3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Bcl11aQ9QYE3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Bcl11aQ9QYE3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Bcl11aQ9QYE3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Bcl11aQ9QYE3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Bcl11aQ9QYE3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Bcl11aQ9QYE3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Bcl11aQ9QYE3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Bcl11aQ9QYE3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Bcl11aQ9QYE3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Bcl11aQ9QYE3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Bcl11aQ9QYE3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Bcl11aQ9QYE3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Bcl11aQ9QYE3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Bcl11aQ9QYE3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Bcl11aQ9QYE3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Bcl11aQ9QYE3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Bcl11aQ9QYE3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Bcl11aQ9QYE3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Bcl11aQ9QYE3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Bcl11aQ9QYE3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Bcl11aQ9QYE3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Bcl11aQ9QYE3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Bcl11aQ9QYE3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Bcl11aQ9QYE3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.7 ms