Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plxnb3Q9QY40 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Plxnb3Q9QY40 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plxnb3Q9QY40 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Plxnb3Q9QY40 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Plxnb3Q9QY40 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Plxnb3Q9QY40 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Plxnb3Q9QY40 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Plxnb3Q9QY40 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Plxnb3Q9QY40 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Plxnb3Q9QY40 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plxnb3Q9QY40 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plxnb3Q9QY40 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plxnb3Q9QY40 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plxnb3Q9QY40 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plxnb3Q9QY40 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plxnb3Q9QY40 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plxnb3Q9QY40 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plxnb3Q9QY40 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plxnb3Q9QY40 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plxnb3Q9QY40 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plxnb3Q9QY40 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plxnb3Q9QY40 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plxnb3Q9QY40 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plxnb3Q9QY40 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plxnb3Q9QY40 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plxnb3Q9QY40 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plxnb3Q9QY40 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plxnb3Q9QY40 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plxnb3Q9QY40 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plxnb3Q9QY40 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plxnb3Q9QY40 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Plxnb3Q9QY40 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Plxnb3Q9QY40 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plxnb3Q9QY40 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plxnb3Q9QY40 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plxnb3Q9QY40 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Plxnb3Q9QY40 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Plxnb3Q9QY40 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plxnb3Q9QY40 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plxnb3Q9QY40 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plxnb3Q9QY40 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Plxnb3Q9QY40 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plxnb3Q9QY40 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plxnb3Q9QY40 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plxnb3Q9QY40 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plxnb3Q9QY40 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plxnb3Q9QY40 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Plxnb3Q9QY40 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plxnb3Q9QY40 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plxnb3Q9QY40 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plxnb3Q9QY40 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxnb3Q9QY40 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxnb3Q9QY40 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxnb3Q9QY40 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxnb3Q9QY40 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxnb3Q9QY40 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxnb3Q9QY40 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxnb3Q9QY40 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxnb3Q9QY40 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxnb3Q9QY40 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plxnb3Q9QY40 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plxnb3Q9QY40 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plxnb3Q9QY40 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plxnb3Q9QY40 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plxnb3Q9QY40 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plxnb3Q9QY40 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plxnb3Q9QY40 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plxnb3Q9QY40 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plxnb3Q9QY40 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plxnb3Q9QY40 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plxnb3Q9QY40 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Plxnb3Q9QY40 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plxnb3Q9QY40 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plxnb3Q9QY40 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Plxnb3Q9QY40 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plxnb3Q9QY40 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plxnb3Q9QY40 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plxnb3Q9QY40 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Plxnb3Q9QY40 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plxnb3Q9QY40 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plxnb3Q9QY40 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plxnb3Q9QY40 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plxnb3Q9QY40 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plxnb3Q9QY40 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plxnb3Q9QY40 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plxnb3Q9QY40 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plxnb3Q9QY40 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plxnb3Q9QY40 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plxnb3Q9QY40 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plxnb3Q9QY40 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plxnb3Q9QY40 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plxnb3Q9QY40 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plxnb3Q9QY40 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plxnb3Q9QY40 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Plxnb3Q9QY40 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plxnb3Q9QY40 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Plxnb3Q9QY40 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plxnb3Q9QY40 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Plxnb3Q9QY40 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms