Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pdzd4Q9QY39 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pdzd4Q9QY39 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdzd4Q9QY39 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdzd4Q9QY39 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdzd4Q9QY39 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdzd4Q9QY39 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdzd4Q9QY39 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdzd4Q9QY39 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdzd4Q9QY39 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdzd4Q9QY39 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdzd4Q9QY39 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdzd4Q9QY39 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdzd4Q9QY39 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdzd4Q9QY39 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzd4Q9QY39 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzd4Q9QY39 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdzd4Q9QY39 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdzd4Q9QY39 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdzd4Q9QY39 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdzd4Q9QY39 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdzd4Q9QY39 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdzd4Q9QY39 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdzd4Q9QY39 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdzd4Q9QY39 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzd4Q9QY39 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzd4Q9QY39 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzd4Q9QY39 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzd4Q9QY39 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzd4Q9QY39 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzd4Q9QY39 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzd4Q9QY39 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzd4Q9QY39 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzd4Q9QY39 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzd4Q9QY39 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzd4Q9QY39 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzd4Q9QY39 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzd4Q9QY39 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzd4Q9QY39 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzd4Q9QY39 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzd4Q9QY39 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzd4Q9QY39 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzd4Q9QY39 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzd4Q9QY39 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzd4Q9QY39 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdzd4Q9QY39 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdzd4Q9QY39 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdzd4Q9QY39 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdzd4Q9QY39 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdzd4Q9QY39 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdzd4Q9QY39 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdzd4Q9QY39 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdzd4Q9QY39 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdzd4Q9QY39 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdzd4Q9QY39 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdzd4Q9QY39 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdzd4Q9QY39 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdzd4Q9QY39 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdzd4Q9QY39 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pdzd4Q9QY39 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdzd4Q9QY39 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdzd4Q9QY39 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdzd4Q9QY39 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms