Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pkp3Q9QY23 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkp3Q9QY23 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkp3Q9QY23 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkp3Q9QY23 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkp3Q9QY23 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkp3Q9QY23 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkp3Q9QY23 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkp3Q9QY23 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkp3Q9QY23 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkp3Q9QY23 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp3Q9QY23 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp3Q9QY23 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp3Q9QY23 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp3Q9QY23 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp3Q9QY23 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp3Q9QY23 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp3Q9QY23 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp3Q9QY23 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp3Q9QY23 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp3Q9QY23 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp3Q9QY23 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp3Q9QY23 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp3Q9QY23 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp3Q9QY23 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp3Q9QY23 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp3Q9QY23 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp3Q9QY23 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp3Q9QY23 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp3Q9QY23 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkp3Q9QY23 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkp3Q9QY23 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkp3Q9QY23 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkp3Q9QY23 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkp3Q9QY23 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkp3Q9QY23 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkp3Q9QY23 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkp3Q9QY23 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms