Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChmQ9QXG2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChmQ9QXG2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChmQ9QXG2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChmQ9QXG2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChmQ9QXG2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChmQ9QXG2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChmQ9QXG2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChmQ9QXG2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ChmQ9QXG2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ChmQ9QXG2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ChmQ9QXG2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChmQ9QXG2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChmQ9QXG2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChmQ9QXG2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChmQ9QXG2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChmQ9QXG2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ChmQ9QXG2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ChmQ9QXG2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ChmQ9QXG2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChmQ9QXG2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChmQ9QXG2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChmQ9QXG2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChmQ9QXG2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ChmQ9QXG2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ChmQ9QXG2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ChmQ9QXG2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ChmQ9QXG2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ChmQ9QXG2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ChmQ9QXG2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ChmQ9QXG2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.7 ms