Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trp53inp1Q9QXE4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trp53inp1Q9QXE4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trp53inp1Q9QXE4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trp53inp1Q9QXE4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trp53inp1Q9QXE4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trp53inp1Q9QXE4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trp53inp1Q9QXE4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trp53inp1Q9QXE4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Trp53inp1Q9QXE4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trp53inp1Q9QXE4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trp53inp1Q9QXE4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trp53inp1Q9QXE4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trp53inp1Q9QXE4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trp53inp1Q9QXE4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trp53inp1Q9QXE4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trp53inp1Q9QXE4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trp53inp1Q9QXE4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trp53inp1Q9QXE4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trp53inp1Q9QXE4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trp53inp1Q9QXE4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trp53inp1Q9QXE4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trp53inp1Q9QXE4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trp53inp1Q9QXE4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trp53inp1Q9QXE4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trp53inp1Q9QXE4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trp53inp1Q9QXE4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trp53inp1Q9QXE4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trp53inp1Q9QXE4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trp53inp1Q9QXE4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trp53inp1Q9QXE4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trp53inp1Q9QXE4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trp53inp1Q9QXE4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trp53inp1Q9QXE4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trp53inp1Q9QXE4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trp53inp1Q9QXE4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trp53inp1Q9QXE4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trp53inp1Q9QXE4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trp53inp1Q9QXE4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trp53inp1Q9QXE4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trp53inp1Q9QXE4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trp53inp1Q9QXE4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trp53inp1Q9QXE4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trp53inp1Q9QXE4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trp53inp1Q9QXE4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trp53inp1Q9QXE4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trp53inp1Q9QXE4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trp53inp1Q9QXE4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trp53inp1Q9QXE4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trp53inp1Q9QXE4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trp53inp1Q9QXE4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trp53inp1Q9QXE4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trp53inp1Q9QXE4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trp53inp1Q9QXE4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trp53inp1Q9QXE4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trp53inp1Q9QXE4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trp53inp1Q9QXE4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trp53inp1Q9QXE4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trp53inp1Q9QXE4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms