Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Homer2Q9QWW1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Homer2Q9QWW1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Homer2Q9QWW1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Homer2Q9QWW1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Homer2Q9QWW1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Homer2Q9QWW1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Homer2Q9QWW1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Homer2Q9QWW1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Homer2Q9QWW1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Homer2Q9QWW1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Homer2Q9QWW1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Homer2Q9QWW1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Homer2Q9QWW1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Homer2Q9QWW1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Homer2Q9QWW1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Homer2Q9QWW1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Homer2Q9QWW1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Homer2Q9QWW1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Homer2Q9QWW1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Homer2Q9QWW1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Homer2Q9QWW1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Homer2Q9QWW1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Homer2Q9QWW1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Homer2Q9QWW1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Homer2Q9QWW1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Homer2Q9QWW1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Homer2Q9QWW1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms