Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Chaf1aQ9QWF0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Chaf1aQ9QWF0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chaf1aQ9QWF0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chaf1aQ9QWF0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chaf1aQ9QWF0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chaf1aQ9QWF0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chaf1aQ9QWF0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chaf1aQ9QWF0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chaf1aQ9QWF0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chaf1aQ9QWF0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chaf1aQ9QWF0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chaf1aQ9QWF0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chaf1aQ9QWF0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Chaf1aQ9QWF0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chaf1aQ9QWF0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chaf1aQ9QWF0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chaf1aQ9QWF0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chaf1aQ9QWF0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chaf1aQ9QWF0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chaf1aQ9QWF0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Chaf1aQ9QWF0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chaf1aQ9QWF0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chaf1aQ9QWF0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chaf1aQ9QWF0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chaf1aQ9QWF0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chaf1aQ9QWF0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Chaf1aQ9QWF0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chaf1aQ9QWF0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Chaf1aQ9QWF0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chaf1aQ9QWF0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chaf1aQ9QWF0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chaf1aQ9QWF0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chaf1aQ9QWF0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chaf1aQ9QWF0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Chaf1aQ9QWF0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Chaf1aQ9QWF0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chaf1aQ9QWF0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chaf1aQ9QWF0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chaf1aQ9QWF0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chaf1aQ9QWF0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chaf1aQ9QWF0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chaf1aQ9QWF0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chaf1aQ9QWF0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Chaf1aQ9QWF0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chaf1aQ9QWF0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chaf1aQ9QWF0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chaf1aQ9QWF0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chaf1aQ9QWF0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chaf1aQ9QWF0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chaf1aQ9QWF0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chaf1aQ9QWF0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chaf1aQ9QWF0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chaf1aQ9QWF0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chaf1aQ9QWF0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Chaf1aQ9QWF0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chaf1aQ9QWF0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chaf1aQ9QWF0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chaf1aQ9QWF0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chaf1aQ9QWF0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chaf1aQ9QWF0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chaf1aQ9QWF0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chaf1aQ9QWF0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chaf1aQ9QWF0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chaf1aQ9QWF0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chaf1aQ9QWF0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chaf1aQ9QWF0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chaf1aQ9QWF0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chaf1aQ9QWF0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chaf1aQ9QWF0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chaf1aQ9QWF0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chaf1aQ9QWF0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chaf1aQ9QWF0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chaf1aQ9QWF0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chaf1aQ9QWF0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chaf1aQ9QWF0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chaf1aQ9QWF0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chaf1aQ9QWF0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chaf1aQ9QWF0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chaf1aQ9QWF0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chaf1aQ9QWF0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chaf1aQ9QWF0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chaf1aQ9QWF0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chaf1aQ9QWF0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chaf1aQ9QWF0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.3 ms