Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rai2Q9QVY8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rai2Q9QVY8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rai2Q9QVY8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rai2Q9QVY8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rai2Q9QVY8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rai2Q9QVY8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rai2Q9QVY8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rai2Q9QVY8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rai2Q9QVY8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rai2Q9QVY8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rai2Q9QVY8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rai2Q9QVY8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rai2Q9QVY8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rai2Q9QVY8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rai2Q9QVY8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rai2Q9QVY8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rai2Q9QVY8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rai2Q9QVY8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rai2Q9QVY8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rai2Q9QVY8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rai2Q9QVY8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rai2Q9QVY8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rai2Q9QVY8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rai2Q9QVY8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rai2Q9QVY8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rai2Q9QVY8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rai2Q9QVY8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rai2Q9QVY8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rai2Q9QVY8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rai2Q9QVY8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rai2Q9QVY8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rai2Q9QVY8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rai2Q9QVY8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rai2Q9QVY8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rai2Q9QVY8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rai2Q9QVY8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rai2Q9QVY8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rai2Q9QVY8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rai2Q9QVY8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rai2Q9QVY8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rai2Q9QVY8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rai2Q9QVY8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rai2Q9QVY8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rai2Q9QVY8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rai2Q9QVY8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rai2Q9QVY8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rai2Q9QVY8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rai2Q9QVY8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rai2Q9QVY8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rai2Q9QVY8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rai2Q9QVY8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rai2Q9QVY8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rai2Q9QVY8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rai2Q9QVY8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rai2Q9QVY8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rai2Q9QVY8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rai2Q9QVY8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rai2Q9QVY8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rai2Q9QVY8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rai2Q9QVY8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rai2Q9QVY8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rai2Q9QVY8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rai2Q9QVY8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rai2Q9QVY8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rai2Q9QVY8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rai2Q9QVY8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rai2Q9QVY8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rai2Q9QVY8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rai2Q9QVY8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rai2Q9QVY8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rai2Q9QVY8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rai2Q9QVY8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rai2Q9QVY8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rai2Q9QVY8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rai2Q9QVY8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rai2Q9QVY8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms