Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM7

Msh5, MutS protein homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh5Q9QUM7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msh5Q9QUM7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Msh5Q9QUM7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msh5Q9QUM7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msh5Q9QUM7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msh5Q9QUM7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msh5Q9QUM7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msh5Q9QUM7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msh5Q9QUM7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msh5Q9QUM7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msh5Q9QUM7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msh5Q9QUM7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msh5Q9QUM7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msh5Q9QUM7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msh5Q9QUM7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msh5Q9QUM7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msh5Q9QUM7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msh5Q9QUM7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msh5Q9QUM7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msh5Q9QUM7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msh5Q9QUM7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msh5Q9QUM7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msh5Q9QUM7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msh5Q9QUM7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msh5Q9QUM7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msh5Q9QUM7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msh5Q9QUM7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Msh5Q9QUM7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Msh5Q9QUM7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Msh5Q9QUM7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Msh5Q9QUM7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Msh5Q9QUM7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Msh5Q9QUM7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Msh5Q9QUM7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Msh5Q9QUM7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Msh5Q9QUM7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Msh5Q9QUM7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Msh5Q9QUM7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Msh5Q9QUM7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msh5Q9QUM7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msh5Q9QUM7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msh5Q9QUM7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msh5Q9QUM7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Msh5Q9QUM7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msh5Q9QUM7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msh5Q9QUM7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msh5Q9QUM7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msh5Q9QUM7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msh5Q9QUM7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msh5Q9QUM7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msh5Q9QUM7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msh5Q9QUM7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msh5Q9QUM7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msh5Q9QUM7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msh5Q9QUM7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msh5Q9QUM7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msh5Q9QUM7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msh5Q9QUM7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msh5Q9QUM7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msh5Q9QUM7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Msh5Q9QUM7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msh5Q9QUM7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msh5Q9QUM7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msh5Q9QUM7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msh5Q9QUM7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.2 ms