Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK6

Tlr4, Toll-like receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr4Q9QUK6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr4Q9QUK6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr4Q9QUK6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr4Q9QUK6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr4Q9QUK6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr4Q9QUK6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr4Q9QUK6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr4Q9QUK6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr4Q9QUK6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr4Q9QUK6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr4Q9QUK6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr4Q9QUK6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr4Q9QUK6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr4Q9QUK6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr4Q9QUK6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr4Q9QUK6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr4Q9QUK6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr4Q9QUK6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr4Q9QUK6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr4Q9QUK6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr4Q9QUK6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr4Q9QUK6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr4Q9QUK6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr4Q9QUK6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr4Q9QUK6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr4Q9QUK6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr4Q9QUK6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr4Q9QUK6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr4Q9QUK6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr4Q9QUK6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tlr4Q9QUK6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlr4Q9QUK6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlr4Q9QUK6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlr4Q9QUK6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlr4Q9QUK6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlr4Q9QUK6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlr4Q9QUK6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr4Q9QUK6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr4Q9QUK6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr4Q9QUK6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr4Q9QUK6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr4Q9QUK6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr4Q9QUK6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr4Q9QUK6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr4Q9QUK6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr4Q9QUK6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr4Q9QUK6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr4Q9QUK6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlr4Q9QUK6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms