Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Csnk1eQ9JMK2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csnk1eQ9JMK2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Csnk1eQ9JMK2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csnk1eQ9JMK2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csnk1eQ9JMK2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms