Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prg3Q9JL95 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Prg3Q9JL95 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Prg3Q9JL95 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prg3Q9JL95 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prg3Q9JL95 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prg3Q9JL95 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prg3Q9JL95 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prg3Q9JL95 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Prg3Q9JL95 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prg3Q9JL95 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prg3Q9JL95 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prg3Q9JL95 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prg3Q9JL95 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prg3Q9JL95 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prg3Q9JL95 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prg3Q9JL95 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prg3Q9JL95 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prg3Q9JL95 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prg3Q9JL95 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Prg3Q9JL95 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Prg3Q9JL95 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prg3Q9JL95 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prg3Q9JL95 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prg3Q9JL95 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prg3Q9JL95 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Prg3Q9JL95 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Prg3Q9JL95 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prg3Q9JL95 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Prg3Q9JL95 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prg3Q9JL95 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prg3Q9JL95 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prg3Q9JL95 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prg3Q9JL95 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prg3Q9JL95 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prg3Q9JL95 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prg3Q9JL95 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prg3Q9JL95 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Prg3Q9JL95 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Prg3Q9JL95 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prg3Q9JL95 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prg3Q9JL95 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prg3Q9JL95 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prg3Q9JL95 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Prg3Q9JL95 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Prg3Q9JL95 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prg3Q9JL95 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prg3Q9JL95 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Prg3Q9JL95 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prg3Q9JL95 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prg3Q9JL95 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prg3Q9JL95 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prg3Q9JL95 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prg3Q9JL95 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prg3Q9JL95 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prg3Q9JL95 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prg3Q9JL95 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prg3Q9JL95 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prg3Q9JL95 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prg3Q9JL95 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prg3Q9JL95 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prg3Q9JL95 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prg3Q9JL95 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prg3Q9JL95 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prg3Q9JL95 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prg3Q9JL95 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prg3Q9JL95 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prg3Q9JL95 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prg3Q9JL95 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prg3Q9JL95 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prg3Q9JL95 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prg3Q9JL95 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prg3Q9JL95 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prg3Q9JL95 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prg3Q9JL95 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prg3Q9JL95 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prg3Q9JL95 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prg3Q9JL95 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prg3Q9JL95 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prg3Q9JL95 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prg3Q9JL95 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prg3Q9JL95 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prg3Q9JL95 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prg3Q9JL95 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prg3Q9JL95 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prg3Q9JL95 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prg3Q9JL95 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prg3Q9JL95 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prg3Q9JL95 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prg3Q9JL95 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prg3Q9JL95 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prg3Q9JL95 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prg3Q9JL95 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prg3Q9JL95 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prg3Q9JL95 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prg3Q9JL95 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prg3Q9JL95 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prg3Q9JL95 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prg3Q9JL95 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prg3Q9JL95 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms