Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnot9Q9JKY0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot9Q9JKY0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cnot9Q9JKY0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms