Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Arl6ip1Q9JKW0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arl6ip1Q9JKW0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arl6ip1Q9JKW0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arl6ip1Q9JKW0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arl6ip1Q9JKW0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arl6ip1Q9JKW0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arl6ip1Q9JKW0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arl6ip1Q9JKW0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arl6ip1Q9JKW0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arl6ip1Q9JKW0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arl6ip1Q9JKW0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arl6ip1Q9JKW0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arl6ip1Q9JKW0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arl6ip1Q9JKW0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Arl6ip1Q9JKW0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arl6ip1Q9JKW0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Arl6ip1Q9JKW0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms