Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Scamp4Q9JKV5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Scamp4Q9JKV5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scamp4Q9JKV5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scamp4Q9JKV5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scamp4Q9JKV5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scamp4Q9JKV5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Scamp4Q9JKV5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scamp4Q9JKV5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Scamp4Q9JKV5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scamp4Q9JKV5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Scamp4Q9JKV5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scamp4Q9JKV5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scamp4Q9JKV5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scamp4Q9JKV5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scamp4Q9JKV5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scamp4Q9JKV5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Scamp4Q9JKV5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Scamp4Q9JKV5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scamp4Q9JKV5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scamp4Q9JKV5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Scamp4Q9JKV5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Scamp4Q9JKV5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scamp4Q9JKV5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Scamp4Q9JKV5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scamp4Q9JKV5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scamp4Q9JKV5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scamp4Q9JKV5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scamp4Q9JKV5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scamp4Q9JKV5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scamp4Q9JKV5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scamp4Q9JKV5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scamp4Q9JKV5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scamp4Q9JKV5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scamp4Q9JKV5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scamp4Q9JKV5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scamp4Q9JKV5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scamp4Q9JKV5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scamp4Q9JKV5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scamp4Q9JKV5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scamp4Q9JKV5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scamp4Q9JKV5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scamp4Q9JKV5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scamp4Q9JKV5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scamp4Q9JKV5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scamp4Q9JKV5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scamp4Q9JKV5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scamp4Q9JKV5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scamp4Q9JKV5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scamp4Q9JKV5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scamp4Q9JKV5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scamp4Q9JKV5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scamp4Q9JKV5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scamp4Q9JKV5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scamp4Q9JKV5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scamp4Q9JKV5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scamp4Q9JKV5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scamp4Q9JKV5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scamp4Q9JKV5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scamp4Q9JKV5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scamp4Q9JKV5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scamp4Q9JKV5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scamp4Q9JKV5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms