Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL4

Ndufaf3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf3Q9JKL4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufaf3Q9JKL4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ndufaf3Q9JKL4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 229.5 ms