Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Trem3Q9JKE1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trem3Q9JKE1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem3Q9JKE1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms