Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG7

Caln1, Calcium-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caln1Q9JJG7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Caln1Q9JJG7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Caln1Q9JJG7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Caln1Q9JJG7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Caln1Q9JJG7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Caln1Q9JJG7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Caln1Q9JJG7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Caln1Q9JJG7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Caln1Q9JJG7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Caln1Q9JJG7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Caln1Q9JJG7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Caln1Q9JJG7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Caln1Q9JJG7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Caln1Q9JJG7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Caln1Q9JJG7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Caln1Q9JJG7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Caln1Q9JJG7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Caln1Q9JJG7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Caln1Q9JJG7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Caln1Q9JJG7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Caln1Q9JJG7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Caln1Q9JJG7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Caln1Q9JJG7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Caln1Q9JJG7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Caln1Q9JJG7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Caln1Q9JJG7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Caln1Q9JJG7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Caln1Q9JJG7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Caln1Q9JJG7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Caln1Q9JJG7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Caln1Q9JJG7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Caln1Q9JJG7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Caln1Q9JJG7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Caln1Q9JJG7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Caln1Q9JJG7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Caln1Q9JJG7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Caln1Q9JJG7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Caln1Q9JJG7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Caln1Q9JJG7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Caln1Q9JJG7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms