Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Efcc1Q9JJF6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Efcc1Q9JJF6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Efcc1Q9JJF6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Efcc1Q9JJF6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Efcc1Q9JJF6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Efcc1Q9JJF6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Efcc1Q9JJF6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Efcc1Q9JJF6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Efcc1Q9JJF6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Efcc1Q9JJF6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Efcc1Q9JJF6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Efcc1Q9JJF6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Efcc1Q9JJF6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Efcc1Q9JJF6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Efcc1Q9JJF6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Efcc1Q9JJF6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Efcc1Q9JJF6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Efcc1Q9JJF6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Efcc1Q9JJF6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Efcc1Q9JJF6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Efcc1Q9JJF6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Efcc1Q9JJF6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Efcc1Q9JJF6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Efcc1Q9JJF6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Efcc1Q9JJF6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Efcc1Q9JJF6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Efcc1Q9JJF6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Efcc1Q9JJF6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Efcc1Q9JJF6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Efcc1Q9JJF6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Efcc1Q9JJF6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Efcc1Q9JJF6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Efcc1Q9JJF6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Efcc1Q9JJF6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Efcc1Q9JJF6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Efcc1Q9JJF6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Efcc1Q9JJF6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Efcc1Q9JJF6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Efcc1Q9JJF6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Efcc1Q9JJF6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Efcc1Q9JJF6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Efcc1Q9JJF6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Efcc1Q9JJF6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Efcc1Q9JJF6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Efcc1Q9JJF6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Efcc1Q9JJF6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Efcc1Q9JJF6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Efcc1Q9JJF6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Efcc1Q9JJF6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Efcc1Q9JJF6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Efcc1Q9JJF6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Efcc1Q9JJF6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Efcc1Q9JJF6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Efcc1Q9JJF6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Efcc1Q9JJF6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Efcc1Q9JJF6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Efcc1Q9JJF6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Efcc1Q9JJF6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Efcc1Q9JJF6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Efcc1Q9JJF6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Efcc1Q9JJF6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Efcc1Q9JJF6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Efcc1Q9JJF6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Efcc1Q9JJF6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Efcc1Q9JJF6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Efcc1Q9JJF6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Efcc1Q9JJF6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Efcc1Q9JJF6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Efcc1Q9JJF6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Efcc1Q9JJF6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Efcc1Q9JJF6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Efcc1Q9JJF6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Efcc1Q9JJF6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Efcc1Q9JJF6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Efcc1Q9JJF6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Efcc1Q9JJF6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Efcc1Q9JJF6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Efcc1Q9JJF6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Efcc1Q9JJF6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Efcc1Q9JJF6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Efcc1Q9JJF6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Efcc1Q9JJF6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Efcc1Q9JJF6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Efcc1Q9JJF6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Efcc1Q9JJF6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Efcc1Q9JJF6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Efcc1Q9JJF6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Efcc1Q9JJF6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Efcc1Q9JJF6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Efcc1Q9JJF6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Efcc1Q9JJF6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Efcc1Q9JJF6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Efcc1Q9JJF6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Efcc1Q9JJF6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Efcc1Q9JJF6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Efcc1Q9JJF6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Efcc1Q9JJF6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Efcc1Q9JJF6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Efcc1Q9JJF6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms