Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Copb1Q9JIF7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Copb1Q9JIF7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Copb1Q9JIF7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Copb1Q9JIF7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Copb1Q9JIF7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Copb1Q9JIF7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Copb1Q9JIF7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Copb1Q9JIF7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Copb1Q9JIF7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Copb1Q9JIF7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Copb1Q9JIF7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Copb1Q9JIF7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Copb1Q9JIF7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Copb1Q9JIF7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Copb1Q9JIF7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Copb1Q9JIF7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Copb1Q9JIF7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Copb1Q9JIF7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Copb1Q9JIF7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Copb1Q9JIF7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Copb1Q9JIF7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Copb1Q9JIF7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Copb1Q9JIF7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Copb1Q9JIF7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Copb1Q9JIF7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Copb1Q9JIF7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Copb1Q9JIF7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Copb1Q9JIF7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Copb1Q9JIF7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Copb1Q9JIF7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Copb1Q9JIF7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Copb1Q9JIF7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Copb1Q9JIF7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Copb1Q9JIF7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Copb1Q9JIF7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Copb1Q9JIF7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Copb1Q9JIF7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Copb1Q9JIF7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Copb1Q9JIF7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Copb1Q9JIF7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Copb1Q9JIF7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Copb1Q9JIF7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Copb1Q9JIF7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Copb1Q9JIF7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Copb1Q9JIF7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Copb1Q9JIF7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Copb1Q9JIF7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Copb1Q9JIF7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Copb1Q9JIF7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Copb1Q9JIF7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Copb1Q9JIF7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Copb1Q9JIF7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Copb1Q9JIF7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Copb1Q9JIF7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Copb1Q9JIF7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Copb1Q9JIF7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Copb1Q9JIF7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Copb1Q9JIF7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Copb1Q9JIF7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Copb1Q9JIF7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Copb1Q9JIF7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Copb1Q9JIF7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Copb1Q9JIF7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Copb1Q9JIF7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Copb1Q9JIF7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Copb1Q9JIF7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Copb1Q9JIF7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Copb1Q9JIF7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Copb1Q9JIF7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Copb1Q9JIF7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Copb1Q9JIF7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Copb1Q9JIF7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Copb1Q9JIF7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Copb1Q9JIF7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms