Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI70

Mkks, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkksQ9JI70 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MkksQ9JI70 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MkksQ9JI70 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MkksQ9JI70 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MkksQ9JI70 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MkksQ9JI70 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MkksQ9JI70 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MkksQ9JI70 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MkksQ9JI70 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MkksQ9JI70 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MkksQ9JI70 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MkksQ9JI70 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MkksQ9JI70 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MkksQ9JI70 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MkksQ9JI70 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MkksQ9JI70 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MkksQ9JI70 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MkksQ9JI70 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MkksQ9JI70 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MkksQ9JI70 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MkksQ9JI70 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MkksQ9JI70 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MkksQ9JI70 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MkksQ9JI70 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MkksQ9JI70 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MkksQ9JI70 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MkksQ9JI70 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MkksQ9JI70 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MkksQ9JI70 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MkksQ9JI70 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MkksQ9JI70 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MkksQ9JI70 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MkksQ9JI70 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MkksQ9JI70 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MkksQ9JI70 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MkksQ9JI70 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MkksQ9JI70 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MkksQ9JI70 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MkksQ9JI70 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MkksQ9JI70 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MkksQ9JI70 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MkksQ9JI70 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MkksQ9JI70 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MkksQ9JI70 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MkksQ9JI70 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MkksQ9JI70 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MkksQ9JI70 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MkksQ9JI70 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MkksQ9JI70 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MkksQ9JI70 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MkksQ9JI70 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MkksQ9JI70 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MkksQ9JI70 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MkksQ9JI70 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MkksQ9JI70 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MkksQ9JI70 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MkksQ9JI70 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MkksQ9JI70 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MkksQ9JI70 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MkksQ9JI70 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MkksQ9JI70 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MkksQ9JI70 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms