Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tcirg1Q9JHF5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tcirg1Q9JHF5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tcirg1Q9JHF5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tcirg1Q9JHF5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcirg1Q9JHF5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcirg1Q9JHF5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcirg1Q9JHF5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcirg1Q9JHF5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcirg1Q9JHF5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcirg1Q9JHF5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcirg1Q9JHF5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcirg1Q9JHF5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tcirg1Q9JHF5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tcirg1Q9JHF5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tcirg1Q9JHF5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tcirg1Q9JHF5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tcirg1Q9JHF5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tcirg1Q9JHF5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tcirg1Q9JHF5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tcirg1Q9JHF5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tcirg1Q9JHF5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tcirg1Q9JHF5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcirg1Q9JHF5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcirg1Q9JHF5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcirg1Q9JHF5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcirg1Q9JHF5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcirg1Q9JHF5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcirg1Q9JHF5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcirg1Q9JHF5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcirg1Q9JHF5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcirg1Q9JHF5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tcirg1Q9JHF5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tcirg1Q9JHF5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcirg1Q9JHF5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcirg1Q9JHF5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms