Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Rb1cc1Q9ESK9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Rb1cc1Q9ESK9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
Rb1cc1Q9ESK9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Rb1cc1Q9ESK9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Rb1cc1Q9ESK9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Rb1cc1Q9ESK9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Rb1cc1Q9ESK9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
Rb1cc1Q9ESK9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
Rb1cc1Q9ESK9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
Rb1cc1Q9ESK9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Rb1cc1Q9ESK9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Rb1cc1Q9ESK9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Rb1cc1Q9ESK9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Rb1cc1Q9ESK9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC41.36■■■■■ 4.21
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Rb1cc1Q9ESK9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
Rb1cc1Q9ESK9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Rb1cc1Q9ESK9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Rb1cc1Q9ESK9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Rb1cc1Q9ESK9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
Rb1cc1Q9ESK9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
Rb1cc1Q9ESK9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
Rb1cc1Q9ESK9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC41.32■■■■■ 4.2
Rb1cc1Q9ESK9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Rb1cc1Q9ESK9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Rb1cc1Q9ESK9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Rb1cc1Q9ESK9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC41.3■■■■■ 4.2
Rb1cc1Q9ESK9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
Rb1cc1Q9ESK9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Rb1cc1Q9ESK9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Rb1cc1Q9ESK9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
Rb1cc1Q9ESK9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Rb1cc1Q9ESK9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Rb1cc1Q9ESK9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
Rb1cc1Q9ESK9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
Rb1cc1Q9ESK9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC41.26■■■■■ 4.2
Rb1cc1Q9ESK9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Rb1cc1Q9ESK9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC41.25■■■■■ 4.19
Rb1cc1Q9ESK9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Rb1cc1Q9ESK9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Rb1cc1Q9ESK9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Rb1cc1Q9ESK9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
Rb1cc1Q9ESK9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
Rb1cc1Q9ESK9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
Rb1cc1Q9ESK9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
Rb1cc1Q9ESK9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
Rb1cc1Q9ESK9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
Rb1cc1Q9ESK9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
Rb1cc1Q9ESK9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC41.2■■■■■ 4.19
Rb1cc1Q9ESK9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Rb1cc1Q9ESK9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC41.17■■■■■ 4.18
Rb1cc1Q9ESK9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC41.17■■■■■ 4.18
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
Rb1cc1Q9ESK9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
Rb1cc1Q9ESK9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Rb1cc1Q9ESK9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC41.14■■■■■ 4.18
Rb1cc1Q9ESK9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.18
Rb1cc1Q9ESK9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
Rb1cc1Q9ESK9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
Rb1cc1Q9ESK9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
Rb1cc1Q9ESK9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
Rb1cc1Q9ESK9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Rb1cc1Q9ESK9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
Rb1cc1Q9ESK9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Rb1cc1Q9ESK9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
Rb1cc1Q9ESK9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
Rb1cc1Q9ESK9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Rb1cc1Q9ESK9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Rb1cc1Q9ESK9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Rb1cc1Q9ESK9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Rb1cc1Q9ESK9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
Rb1cc1Q9ESK9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms