Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ube3bQ9ES34 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ube3bQ9ES34 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ube3bQ9ES34 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ube3bQ9ES34 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ube3bQ9ES34 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ube3bQ9ES34 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ube3bQ9ES34 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ube3bQ9ES34 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ube3bQ9ES34 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ube3bQ9ES34 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ube3bQ9ES34 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ube3bQ9ES34 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ube3bQ9ES34 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ube3bQ9ES34 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ube3bQ9ES34 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ube3bQ9ES34 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ube3bQ9ES34 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ube3bQ9ES34 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ube3bQ9ES34 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ube3bQ9ES34 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ube3bQ9ES34 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ube3bQ9ES34 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ube3bQ9ES34 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ube3bQ9ES34 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ube3bQ9ES34 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ube3bQ9ES34 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ube3bQ9ES34 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ube3bQ9ES34 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ube3bQ9ES34 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ube3bQ9ES34 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ube3bQ9ES34 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ube3bQ9ES34 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ube3bQ9ES34 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ube3bQ9ES34 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ube3bQ9ES34 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ube3bQ9ES34 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ube3bQ9ES34 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ube3bQ9ES34 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ube3bQ9ES34 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ube3bQ9ES34 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ube3bQ9ES34 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ube3bQ9ES34 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ube3bQ9ES34 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ube3bQ9ES34 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ube3bQ9ES34 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ube3bQ9ES34 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ube3bQ9ES34 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ube3bQ9ES34 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ube3bQ9ES34 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ube3bQ9ES34 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ube3bQ9ES34 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ube3bQ9ES34 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ube3bQ9ES34 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ube3bQ9ES34 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ube3bQ9ES34 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ube3bQ9ES34 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ube3bQ9ES34 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ube3bQ9ES34 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ube3bQ9ES34 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ube3bQ9ES34 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ube3bQ9ES34 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ube3bQ9ES34 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ube3bQ9ES34 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ube3bQ9ES34 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ube3bQ9ES34 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ube3bQ9ES34 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ube3bQ9ES34 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ube3bQ9ES34 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ube3bQ9ES34 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ube3bQ9ES34 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ube3bQ9ES34 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ube3bQ9ES34 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ube3bQ9ES34 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ube3bQ9ES34 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ube3bQ9ES34 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ube3bQ9ES34 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ube3bQ9ES34 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ube3bQ9ES34 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ube3bQ9ES34 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ube3bQ9ES34 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ube3bQ9ES34 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ube3bQ9ES34 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ube3bQ9ES34 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ube3bQ9ES34 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ube3bQ9ES34 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ube3bQ9ES34 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ube3bQ9ES34 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ube3bQ9ES34 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ube3bQ9ES34 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ube3bQ9ES34 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ube3bQ9ES34 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ube3bQ9ES34 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ube3bQ9ES34 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ube3bQ9ES34 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ube3bQ9ES34 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ube3bQ9ES34 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ube3bQ9ES34 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ube3bQ9ES34 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ube3bQ9ES34 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms