Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc28a3Q9ERH8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc28a3Q9ERH8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc28a3Q9ERH8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc28a3Q9ERH8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc28a3Q9ERH8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc28a3Q9ERH8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc28a3Q9ERH8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc28a3Q9ERH8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc28a3Q9ERH8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc28a3Q9ERH8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc28a3Q9ERH8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc28a3Q9ERH8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc28a3Q9ERH8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc28a3Q9ERH8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc28a3Q9ERH8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc28a3Q9ERH8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc28a3Q9ERH8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc28a3Q9ERH8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc28a3Q9ERH8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc28a3Q9ERH8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc28a3Q9ERH8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc28a3Q9ERH8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc28a3Q9ERH8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc28a3Q9ERH8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc28a3Q9ERH8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc28a3Q9ERH8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc28a3Q9ERH8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc28a3Q9ERH8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc28a3Q9ERH8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc28a3Q9ERH8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc28a3Q9ERH8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc28a3Q9ERH8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc28a3Q9ERH8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc28a3Q9ERH8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc28a3Q9ERH8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc28a3Q9ERH8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc28a3Q9ERH8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc28a3Q9ERH8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc28a3Q9ERH8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc28a3Q9ERH8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc28a3Q9ERH8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc28a3Q9ERH8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc28a3Q9ERH8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc28a3Q9ERH8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc28a3Q9ERH8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc28a3Q9ERH8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc28a3Q9ERH8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc28a3Q9ERH8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc28a3Q9ERH8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc28a3Q9ERH8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc28a3Q9ERH8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc28a3Q9ERH8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc28a3Q9ERH8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc28a3Q9ERH8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc28a3Q9ERH8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc28a3Q9ERH8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc28a3Q9ERH8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc28a3Q9ERH8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc28a3Q9ERH8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc28a3Q9ERH8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc28a3Q9ERH8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc28a3Q9ERH8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc28a3Q9ERH8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc28a3Q9ERH8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc28a3Q9ERH8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc28a3Q9ERH8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc28a3Q9ERH8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc28a3Q9ERH8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc28a3Q9ERH8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc28a3Q9ERH8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc28a3Q9ERH8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc28a3Q9ERH8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc28a3Q9ERH8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc28a3Q9ERH8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc28a3Q9ERH8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc28a3Q9ERH8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slc28a3Q9ERH8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc28a3Q9ERH8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc28a3Q9ERH8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc28a3Q9ERH8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc28a3Q9ERH8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc28a3Q9ERH8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc28a3Q9ERH8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms