Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Dap3Q9ER88 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dap3Q9ER88 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dap3Q9ER88 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dap3Q9ER88 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dap3Q9ER88 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dap3Q9ER88 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dap3Q9ER88 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dap3Q9ER88 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dap3Q9ER88 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Dap3Q9ER88 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dap3Q9ER88 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dap3Q9ER88 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dap3Q9ER88 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dap3Q9ER88 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dap3Q9ER88 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dap3Q9ER88 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dap3Q9ER88 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dap3Q9ER88 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dap3Q9ER88 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dap3Q9ER88 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dap3Q9ER88 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dap3Q9ER88 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dap3Q9ER88 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dap3Q9ER88 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dap3Q9ER88 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dap3Q9ER88 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Dap3Q9ER88 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms