Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn12Q9ER56 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn12Q9ER56 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn12Q9ER56 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn12Q9ER56 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn12Q9ER56 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn12Q9ER56 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn12Q9ER56 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn12Q9ER56 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn12Q9ER56 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn12Q9ER56 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn12Q9ER56 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn12Q9ER56 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn12Q9ER56 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn12Q9ER56 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn12Q9ER56 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn12Q9ER56 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn12Q9ER56 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Capn12Q9ER56 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Capn12Q9ER56 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Capn12Q9ER56 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Capn12Q9ER56 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Capn12Q9ER56 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Capn12Q9ER56 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Capn12Q9ER56 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Capn12Q9ER56 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn12Q9ER56 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn12Q9ER56 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn12Q9ER56 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn12Q9ER56 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn12Q9ER56 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn12Q9ER56 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn12Q9ER56 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn12Q9ER56 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn12Q9ER56 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn12Q9ER56 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn12Q9ER56 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn12Q9ER56 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn12Q9ER56 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn12Q9ER56 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn12Q9ER56 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn12Q9ER56 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn12Q9ER56 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn12Q9ER56 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn12Q9ER56 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn12Q9ER56 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn12Q9ER56 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn12Q9ER56 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn12Q9ER56 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn12Q9ER56 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn12Q9ER56 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn12Q9ER56 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn12Q9ER56 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn12Q9ER56 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn12Q9ER56 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Capn12Q9ER56 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn12Q9ER56 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn12Q9ER56 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn12Q9ER56 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn12Q9ER56 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn12Q9ER56 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn12Q9ER56 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn12Q9ER56 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn12Q9ER56 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn12Q9ER56 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn12Q9ER56 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn12Q9ER56 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn12Q9ER56 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn12Q9ER56 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn12Q9ER56 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn12Q9ER56 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn12Q9ER56 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn12Q9ER56 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn12Q9ER56 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn12Q9ER56 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn12Q9ER56 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn12Q9ER56 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn12Q9ER56 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn12Q9ER56 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn12Q9ER56 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn12Q9ER56 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn12Q9ER56 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn12Q9ER56 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn12Q9ER56 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn12Q9ER56 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn12Q9ER56 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms