Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rapgef4Q9EQZ6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
Rapgef4Q9EQZ6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rapgef4Q9EQZ6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rapgef4Q9EQZ6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rapgef4Q9EQZ6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rapgef4Q9EQZ6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rapgef4Q9EQZ6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rapgef4Q9EQZ6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rapgef4Q9EQZ6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
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