Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndst3Q9EQH7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndst3Q9EQH7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndst3Q9EQH7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndst3Q9EQH7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndst3Q9EQH7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndst3Q9EQH7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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Ndst3Q9EQH7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ndst3Q9EQH7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ndst3Q9EQH7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ndst3Q9EQH7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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Ndst3Q9EQH7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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Ndst3Q9EQH7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ndst3Q9EQH7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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Ndst3Q9EQH7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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Ndst3Q9EQH7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
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Ndst3Q9EQH7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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Ndst3Q9EQH7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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Ndst3Q9EQH7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndst3Q9EQH7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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Ndst3Q9EQH7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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Ndst3Q9EQH7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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Ndst3Q9EQH7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndst3Q9EQH7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndst3Q9EQH7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndst3Q9EQH7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndst3Q9EQH7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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Ndst3Q9EQH7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndst3Q9EQH7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndst3Q9EQH7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndst3Q9EQH7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndst3Q9EQH7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndst3Q9EQH7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
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Ndst3Q9EQH7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ndst3Q9EQH7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ndst3Q9EQH7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ndst3Q9EQH7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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Ndst3Q9EQH7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Ndst3Q9EQH7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Ndst3Q9EQH7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndst3Q9EQH7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndst3Q9EQH7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndst3Q9EQH7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndst3Q9EQH7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndst3Q9EQH7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndst3Q9EQH7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Ndst3Q9EQH7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndst3Q9EQH7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndst3Q9EQH7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndst3Q9EQH7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndst3Q9EQH7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndst3Q9EQH7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndst3Q9EQH7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndst3Q9EQH7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndst3Q9EQH7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndst3Q9EQH7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndst3Q9EQH7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndst3Q9EQH7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndst3Q9EQH7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Ndst3Q9EQH7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndst3Q9EQH7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndst3Q9EQH7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndst3Q9EQH7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndst3Q9EQH7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
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