Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clstn1Q9EPL2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clstn1Q9EPL2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clstn1Q9EPL2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clstn1Q9EPL2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clstn1Q9EPL2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clstn1Q9EPL2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clstn1Q9EPL2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clstn1Q9EPL2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clstn1Q9EPL2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clstn1Q9EPL2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clstn1Q9EPL2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clstn1Q9EPL2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clstn1Q9EPL2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clstn1Q9EPL2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clstn1Q9EPL2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clstn1Q9EPL2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clstn1Q9EPL2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clstn1Q9EPL2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clstn1Q9EPL2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clstn1Q9EPL2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clstn1Q9EPL2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clstn1Q9EPL2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clstn1Q9EPL2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clstn1Q9EPL2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clstn1Q9EPL2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Clstn1Q9EPL2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Clstn1Q9EPL2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clstn1Q9EPL2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clstn1Q9EPL2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clstn1Q9EPL2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clstn1Q9EPL2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clstn1Q9EPL2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Clstn1Q9EPL2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clstn1Q9EPL2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clstn1Q9EPL2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clstn1Q9EPL2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clstn1Q9EPL2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clstn1Q9EPL2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clstn1Q9EPL2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clstn1Q9EPL2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clstn1Q9EPL2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clstn1Q9EPL2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clstn1Q9EPL2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clstn1Q9EPL2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clstn1Q9EPL2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clstn1Q9EPL2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clstn1Q9EPL2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clstn1Q9EPL2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clstn1Q9EPL2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clstn1Q9EPL2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clstn1Q9EPL2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clstn1Q9EPL2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clstn1Q9EPL2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clstn1Q9EPL2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clstn1Q9EPL2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clstn1Q9EPL2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clstn1Q9EPL2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clstn1Q9EPL2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clstn1Q9EPL2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clstn1Q9EPL2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clstn1Q9EPL2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clstn1Q9EPL2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clstn1Q9EPL2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clstn1Q9EPL2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clstn1Q9EPL2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clstn1Q9EPL2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Clstn1Q9EPL2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clstn1Q9EPL2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clstn1Q9EPL2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clstn1Q9EPL2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clstn1Q9EPL2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clstn1Q9EPL2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clstn1Q9EPL2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clstn1Q9EPL2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clstn1Q9EPL2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Clstn1Q9EPL2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clstn1Q9EPL2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clstn1Q9EPL2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clstn1Q9EPL2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clstn1Q9EPL2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clstn1Q9EPL2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clstn1Q9EPL2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clstn1Q9EPL2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clstn1Q9EPL2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clstn1Q9EPL2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clstn1Q9EPL2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clstn1Q9EPL2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clstn1Q9EPL2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clstn1Q9EPL2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clstn1Q9EPL2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clstn1Q9EPL2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clstn1Q9EPL2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clstn1Q9EPL2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clstn1Q9EPL2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clstn1Q9EPL2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clstn1Q9EPL2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clstn1Q9EPL2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clstn1Q9EPL2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms