Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnft1Q9DCN7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnft1Q9DCN7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnft1Q9DCN7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnft1Q9DCN7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnft1Q9DCN7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnft1Q9DCN7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnft1Q9DCN7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnft1Q9DCN7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnft1Q9DCN7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnft1Q9DCN7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnft1Q9DCN7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnft1Q9DCN7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnft1Q9DCN7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnft1Q9DCN7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnft1Q9DCN7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnft1Q9DCN7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnft1Q9DCN7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnft1Q9DCN7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnft1Q9DCN7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnft1Q9DCN7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnft1Q9DCN7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnft1Q9DCN7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnft1Q9DCN7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnft1Q9DCN7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnft1Q9DCN7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnft1Q9DCN7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnft1Q9DCN7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnft1Q9DCN7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rnft1Q9DCN7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnft1Q9DCN7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnft1Q9DCN7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnft1Q9DCN7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnft1Q9DCN7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnft1Q9DCN7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnft1Q9DCN7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnft1Q9DCN7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rnft1Q9DCN7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rnft1Q9DCN7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnft1Q9DCN7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnft1Q9DCN7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnft1Q9DCN7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnft1Q9DCN7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnft1Q9DCN7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rnft1Q9DCN7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rnft1Q9DCN7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnft1Q9DCN7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rnft1Q9DCN7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnft1Q9DCN7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnft1Q9DCN7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rnft1Q9DCN7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rnft1Q9DCN7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnft1Q9DCN7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnft1Q9DCN7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 406.9 ms