Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trmt112Q9DCG9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trmt112Q9DCG9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trmt112Q9DCG9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trmt112Q9DCG9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trmt112Q9DCG9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trmt112Q9DCG9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trmt112Q9DCG9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trmt112Q9DCG9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trmt112Q9DCG9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trmt112Q9DCG9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trmt112Q9DCG9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trmt112Q9DCG9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trmt112Q9DCG9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trmt112Q9DCG9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trmt112Q9DCG9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trmt112Q9DCG9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trmt112Q9DCG9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trmt112Q9DCG9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trmt112Q9DCG9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trmt112Q9DCG9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trmt112Q9DCG9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trmt112Q9DCG9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trmt112Q9DCG9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trmt112Q9DCG9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trmt112Q9DCG9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trmt112Q9DCG9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trmt112Q9DCG9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trmt112Q9DCG9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trmt112Q9DCG9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trmt112Q9DCG9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trmt112Q9DCG9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trmt112Q9DCG9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trmt112Q9DCG9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Trmt112Q9DCG9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trmt112Q9DCG9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trmt112Q9DCG9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trmt112Q9DCG9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trmt112Q9DCG9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Trmt112Q9DCG9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trmt112Q9DCG9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trmt112Q9DCG9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trmt112Q9DCG9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Trmt112Q9DCG9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trmt112Q9DCG9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trmt112Q9DCG9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trmt112Q9DCG9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trmt112Q9DCG9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trmt112Q9DCG9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Trmt112Q9DCG9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trmt112Q9DCG9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trmt112Q9DCG9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trmt112Q9DCG9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trmt112Q9DCG9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trmt112Q9DCG9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trmt112Q9DCG9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trmt112Q9DCG9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trmt112Q9DCG9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trmt112Q9DCG9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Trmt112Q9DCG9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trmt112Q9DCG9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trmt112Q9DCG9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trmt112Q9DCG9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trmt112Q9DCG9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trmt112Q9DCG9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trmt112Q9DCG9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trmt112Q9DCG9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trmt112Q9DCG9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trmt112Q9DCG9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trmt112Q9DCG9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Trmt112Q9DCG9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trmt112Q9DCG9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trmt112Q9DCG9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trmt112Q9DCG9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trmt112Q9DCG9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trmt112Q9DCG9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trmt112Q9DCG9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trmt112Q9DCG9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trmt112Q9DCG9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trmt112Q9DCG9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trmt112Q9DCG9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trmt112Q9DCG9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trmt112Q9DCG9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trmt112Q9DCG9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trmt112Q9DCG9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trmt112Q9DCG9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trmt112Q9DCG9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trmt112Q9DCG9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trmt112Q9DCG9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trmt112Q9DCG9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trmt112Q9DCG9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trmt112Q9DCG9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Trmt112Q9DCG9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trmt112Q9DCG9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.8 ms