Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csnk1dQ9DC28 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csnk1dQ9DC28 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csnk1dQ9DC28 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csnk1dQ9DC28 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csnk1dQ9DC28 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csnk1dQ9DC28 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csnk1dQ9DC28 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csnk1dQ9DC28 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csnk1dQ9DC28 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Csnk1dQ9DC28 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csnk1dQ9DC28 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csnk1dQ9DC28 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csnk1dQ9DC28 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csnk1dQ9DC28 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csnk1dQ9DC28 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csnk1dQ9DC28 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csnk1dQ9DC28 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csnk1dQ9DC28 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csnk1dQ9DC28 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csnk1dQ9DC28 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csnk1dQ9DC28 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csnk1dQ9DC28 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csnk1dQ9DC28 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csnk1dQ9DC28 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csnk1dQ9DC28 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csnk1dQ9DC28 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csnk1dQ9DC28 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csnk1dQ9DC28 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csnk1dQ9DC28 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csnk1dQ9DC28 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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