Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc97Q9DBT3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms