Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcg8Q9DBM0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Abcg8Q9DBM0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcg8Q9DBM0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcg8Q9DBM0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcg8Q9DBM0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcg8Q9DBM0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcg8Q9DBM0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcg8Q9DBM0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms