Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Med27Q9DB40 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Med27Q9DB40 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Med27Q9DB40 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Med27Q9DB40 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Med27Q9DB40 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Med27Q9DB40 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Med27Q9DB40 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Med27Q9DB40 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Med27Q9DB40 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med27Q9DB40 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med27Q9DB40 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med27Q9DB40 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Med27Q9DB40 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med27Q9DB40 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med27Q9DB40 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med27Q9DB40 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med27Q9DB40 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med27Q9DB40 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med27Q9DB40 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med27Q9DB40 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med27Q9DB40 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med27Q9DB40 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med27Q9DB40 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med27Q9DB40 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med27Q9DB40 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med27Q9DB40 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med27Q9DB40 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med27Q9DB40 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med27Q9DB40 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med27Q9DB40 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med27Q9DB40 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med27Q9DB40 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med27Q9DB40 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med27Q9DB40 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med27Q9DB40 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med27Q9DB40 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med27Q9DB40 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med27Q9DB40 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Med27Q9DB40 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Med27Q9DB40 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms