Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Pop5Q9DB28 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pop5Q9DB28 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pop5Q9DB28 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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Pop5Q9DB28 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pop5Q9DB28 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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Pop5Q9DB28 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pop5Q9DB28 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pop5Q9DB28 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pop5Q9DB28 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pop5Q9DB28 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pop5Q9DB28 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Pop5Q9DB28 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pop5Q9DB28 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pop5Q9DB28 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pop5Q9DB28 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pop5Q9DB28 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pop5Q9DB28 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pop5Q9DB28 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pop5Q9DB28 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pop5Q9DB28 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Pop5Q9DB28 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pop5Q9DB28 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pop5Q9DB28 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pop5Q9DB28 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pop5Q9DB28 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pop5Q9DB28 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pop5Q9DB28 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pop5Q9DB28 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pop5Q9DB28 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pop5Q9DB28 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms