Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm2aQ9DAR1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm2aQ9DAR1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm2aQ9DAR1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmtm2aQ9DAR1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmtm2aQ9DAR1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmtm2aQ9DAR1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmtm2aQ9DAR1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmtm2aQ9DAR1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmtm2aQ9DAR1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmtm2aQ9DAR1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmtm2aQ9DAR1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmtm2aQ9DAR1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm2aQ9DAR1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm2aQ9DAR1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm2aQ9DAR1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm2aQ9DAR1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm2aQ9DAR1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cmtm2aQ9DAR1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cmtm2aQ9DAR1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cmtm2aQ9DAR1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cmtm2aQ9DAR1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cmtm2aQ9DAR1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cmtm2aQ9DAR1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cmtm2aQ9DAR1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cmtm2aQ9DAR1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cmtm2aQ9DAR1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cmtm2aQ9DAR1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cmtm2aQ9DAR1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cmtm2aQ9DAR1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cmtm2aQ9DAR1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cmtm2aQ9DAR1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cmtm2aQ9DAR1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cmtm2aQ9DAR1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cmtm2aQ9DAR1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cmtm2aQ9DAR1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cmtm2aQ9DAR1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cmtm2aQ9DAR1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cmtm2aQ9DAR1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cmtm2aQ9DAR1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cmtm2aQ9DAR1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cmtm2aQ9DAR1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms