Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP0

Lrrc46, Leucine-rich repeat-containing protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc46Q9DAP0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc46Q9DAP0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc46Q9DAP0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc46Q9DAP0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc46Q9DAP0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc46Q9DAP0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc46Q9DAP0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc46Q9DAP0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc46Q9DAP0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc46Q9DAP0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc46Q9DAP0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc46Q9DAP0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc46Q9DAP0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrrc46Q9DAP0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrrc46Q9DAP0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrrc46Q9DAP0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrc46Q9DAP0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrc46Q9DAP0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc46Q9DAP0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc46Q9DAP0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc46Q9DAP0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc46Q9DAP0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc46Q9DAP0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc46Q9DAP0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc46Q9DAP0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc46Q9DAP0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc46Q9DAP0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc46Q9DAP0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc46Q9DAP0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc46Q9DAP0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc46Q9DAP0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc46Q9DAP0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc46Q9DAP0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc46Q9DAP0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc46Q9DAP0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc46Q9DAP0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc46Q9DAP0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc46Q9DAP0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc46Q9DAP0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc46Q9DAP0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc46Q9DAP0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc46Q9DAP0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc46Q9DAP0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc46Q9DAP0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc46Q9DAP0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc46Q9DAP0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc46Q9DAP0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lrrc46Q9DAP0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc46Q9DAP0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc46Q9DAP0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc46Q9DAP0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc46Q9DAP0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc46Q9DAP0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc46Q9DAP0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc46Q9DAP0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc46Q9DAP0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc46Q9DAP0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc46Q9DAP0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc46Q9DAP0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc46Q9DAP0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc46Q9DAP0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc46Q9DAP0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc46Q9DAP0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc46Q9DAP0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc46Q9DAP0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc46Q9DAP0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc46Q9DAP0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc46Q9DAP0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc46Q9DAP0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc46Q9DAP0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc46Q9DAP0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc46Q9DAP0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc46Q9DAP0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc46Q9DAP0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc46Q9DAP0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc46Q9DAP0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc46Q9DAP0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc46Q9DAP0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc46Q9DAP0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc46Q9DAP0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc46Q9DAP0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc46Q9DAP0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc46Q9DAP0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc46Q9DAP0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc46Q9DAP0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc46Q9DAP0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc46Q9DAP0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc46Q9DAP0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc46Q9DAP0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc46Q9DAP0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc46Q9DAP0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc46Q9DAP0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc46Q9DAP0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc46Q9DAP0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc46Q9DAP0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc46Q9DAP0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc46Q9DAP0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc46Q9DAP0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc46Q9DAP0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc46Q9DAP0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms