Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc54Q9DAL3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc54Q9DAL3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms